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与植物抗逆相关的miR-398-3p基因家族进化分析及靶基因预测

Moleculer evelution of miR-398-3p gene family and prediction of their target gene

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【作者】 薛巨坤王博王莲萍杨春雨国会艳郝爱平

【Author】 XUE Ju-kun;WANG Bo;WANG Lian-ping;YANG Chun-yu;GUO Hui-yan;HAO Ai-ping;College of Life Sciences and Technology,Mudanjiang Normal College;

【通讯作者】 郝爱平;

【机构】 牡丹江师范学院生命科学与技术学院

【摘要】 通过生物信息学方法对miR-398-3p基因家族进行序列分析和靶基因预测。结果表明,大部分miR-398-3p基因分布在不同的染色体上,miR-398-3p序列在不同物种间具有高度的保守性。进化分析结果表明,miR-398-3p基因家族的成员呈现为7个分支,个别物种miR-398-3p的不同成员具有较远的亲缘关系;miR-398-3p的靶基因具有超氧化物歧化酶[Cu-Zn]、花粉特异性蛋白质SF3、锌指蛋白WIP2、C2H2型锌指家族蛋白等功能,参与植物的生物和非生物胁迫及生长发育调控过程。

【Abstract】 In this paper,the miR-398-3p gene family were analyzed by bioinformatics method and the target genes were predicted.The results showed that most miR-398-3p genes were scattered on different chromosomes,and the miR-398-3p sequence was highly conserved among different species.The miR-398-3p gene family showed that the miR-398-3p gene was composed of seven branches,and the different members of miR-398-3p had a distant genetic relationship.The miR-398-3p family regulated superoxide dismutase [Cu-Zn],pollen-specific protein SF3,zinc finger protein WIP2,C2 H2 type zinc finger family protein and other respects,were involved in plant biological and abiotic stress and growth and development control process.

【关键词】 miR-398-3p生物信息学靶基因植物抗逆
【Key words】 MiR-398-3pbioinformaticstarget geneplant resistance
【基金】 黑龙江省教育厅备案项目(1352MSYYB002);国家自然科学基金项目(31700587)
  • 【文献出处】 湖北农业科学 ,Hubei Agricultural Sciences , 编辑部邮箱 ,2019年14期
  • 【分类号】Q943.2
  • 【被引频次】1
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