基于SNP芯片分析鉴定大白猪、长白猪与杜洛克猪的品种成分

【摘要】 保证种猪核心育种群中的猪只均为纯品种，是为专门化品系及配套系的培育提供优良种质资源的基础。然而在大型养猪公司的引种过程中，以杂种猪冒充纯种猪的现象时有发生，这为养猪公司带来了巨大的经济损失。为了探究如何对核心群种猪进行品种成分鉴定，本研究利用Illumina 50K SNP芯片对四川省某猪场5 723个个体进行SNP测定。通过主成分分析（Principal Component Analysis,PCA）及群体遗传结构分析对混杂群体样本进行品种成分鉴定，结果显示主成分1和主成分2可以快速准确地依照猪只品种进行分群。通过群体遗传结构分析发现，当K=3时，样本群体可以按照品种间的遗传差异进行分群。在分品种估算个体育种值和进行核心群引种时，为了保证种猪群体的品种纯度，可以利用种猪的基因型数据进行快速且准确的种猪品种成分鉴定。该研究成果可以实际应用于种猪核心育种群的引种及育种值估算工作，充分保障核心育种群的品种纯度，也为我国大型养猪公司体系内场间联合育种的发展与改进提供了切实可行的参考方案。更多还原